Theo sách Địa chí Hà Bắc (1982) thì chùa có từ đời vua Trần Thánh Tông (1258-1278). Thiền sư Huyền Quang (đỗ Trạng nguyên năm 1297) đã trụ trì ở đây. Ông cho dựng ngọn tháp đá cao 9 tầng có trang trí hình hoa sen. Ngọn tháp này nay không còn nữa.

Chùa Bút Tháp đã trải qua rất nhiều thời sư trụ trì và được xây dựng trong một khoảng thời gian rất dài mới hoàn thành xong, kèm theo đó là những tích truyện nổi tiếng.

Nằm bên bờ sông Đuống, chùa Bút Tháp được xem là ngôi chùa cổ kính, nổi tiếng ở Bắc Ninh. Sở dĩ nơi này được gọi là chùa Bút Tháp vì ngôi chùa có hình dáng cây bút nằm hiên ngang giữa trời, bên những cánh đồng bát ngát, mênh mông.

Không chỉ nổi tiếng với nét đẹp cổ kính, nghệ thuật độc đáo mà chùa Bút Tháp còn được nhiều người biết đến bởi nơi này sở hữu tượng Phật bà Quan Âm nghìn mắt nghìn tay bằng gỗ lớn nhất ở nước ta.

Là một trong những ngôi chùa cổ và có kiến trúc độc đáo của tỉnh Bắc Ninh, đặt chân đến chùa Bút Tháp, bạn sẽ được tự do sải bước trong khuôn viên rộng lớn, khoáng đạt và tĩnh mịch.

Nhờ vẻ đẹp mộc mạc, trang nghiêm, chùa Bút Tháp sẽ mãi là điểm dừng chân lý tưởng cho những ai muốn tìm về nguồn cội tâm linh.